Program S2 Dalam Negeri
Program S2 Dalam Negeri adalah program kuliah yang harus ditempuh dalam jangka waktu selama kurang lebih 18 bulan. Program beasiswa ini tersedia di sebelas universitas dalam negeri, yakni Universitas Syiah Kuala, Universitas Andalas, Universitas Sriwijaya, Universitas Indonesia, Institut Pertanian Bogor, Institut Teknologi Bandung, Universitas Padjajaran, Universitas Diponegoro, Universitas Gadjah Mada, Universitas Brawijaya, dan Universitas Hasanuddin.
Baca juga: Penjelasan Persyaratan Dokumen Beasiswa Merdeka Pendidikan untuk Pelajar dan Mahasiswa
Program S2 Tematik Smart City
Program beasiswa jenjang S2 ini diselenggarakan dengan tujuan untuk mendukung gerakan membangun smart city yang dikembangkan oleh beberapa Kementerian/Lembaga. Program ini berdurasi maksimum 24 bulan dengan memasukkan kegiatan magang pada slot deposit dana institusi yang menyelenggarakan program smart city. Terdapat tiga pilihan universitas untuk program ini, yakni Universitas Gadjah Mada, Universitas Diponegoro, dan Institut Teknologi Bandung.
Program S2 Luar Negeri di Jepang
Program ini khusus untuk perkuliahan di Jepang dengan durasi perkuliahan selama dua tahun. Program beasiswa ini tersedia untuk program studi yang berkaitan dengan perencanaan yang telah diakui oleh Kemenristek Dikti serta mendapatkan persetujuan dari Pusbindiklatren Bappenas. Bagi pendaftar yang berhasil lolos seleksi akan mendapatkan kelas persiapan bahasa Inggris dan bahasa Jepang selama kurang lebih waktu 6 hingga 7,5 bulan. Pelaksanaan kelas persiapan bahasa ini akan dilaksanakan sebelum keberangkatan ke Jepang.